ChemDraw 25.0新版本引入了一系列增强功能,旨在改进大分子和互补链的绘制与表征。本次最新发布还包括安装和系统优化,以及化学智能的进一步升级。此外,还修复了若干小型缺陷。
本次更新包含以下内容:
高阶的生物聚合物表征(HELM)优化 --改进了生物聚合物的可视化与结构整理功能 生物聚合物序列间连接线改为弯曲形状,提升了视觉效果和结构可读性 提供灵活的生物聚合物显示换行选项 现在可在互补DNA/RNA链之间绘制氢键 HELM字符串现已支持atom-mapped SMILES 支持HELM内嵌注释、正义链/反义链标注以及RNA/DNA的5'和3'末端标识
增强化学智能 统一处理配位键(coordination bonds)和给予键(dative bonds) 更新了累积二烯烃和阻转异构体的立体化学标记(从R/S更新为M/P)
安装与系统优化 安装流程简化,合并“所有用户/当前用户”选项,优化安装程序执行 ChemDraw现已支持ARM架构和Intel架构的Mac设备 提供独立的ChemDraw和ChemDraw应用合集安装程序
高阶生物聚合物(HELM)改进
ChemDraw对复杂生物聚合物序列的表征进行了显著改进,以更清晰、简洁地显示复杂序列。此项改进包括更新序列间交联的可视化和路径处理,以及为序列内所有单体生成更整洁的结构视图。 生物聚合物序列间的交联线现已改为弯曲形状,取代了以往的直角设计。这一变化大幅提升了复杂结构的可读性,使用户更容易区分交联与单体间的化学连接。
ChemDraw现已为生物聚合物绘制与显示提供更多灵活选项。用户可在“生物聚合物文档设置(biopolymer document settings)”中设置每行残基数,或可选择完全禁用序列换行功能。当关闭换行时,序列将以单行连续显示。此外,残基分块(residues per block)选项已从显示设置中移除。
研究人员现可在ChemDraw中手动绘制包含非天然碱基的DNA/RNA互补链之间的氢键。只需选择氢键工具,即可根据沃森-克里克(Watson-Crick)配对原则放置合适的氢键。
在插入或粘贴HELM字符串时,ChemDraw现已支持带Atom-mapped SMILES。此处,当为包含未知或内嵌单体的序列生成HELM字符串时,输出也将使用Auto-mapped SMILES,替代此前使用的extended SMILES格式。
ChemDraw支持对单体与聚合物的内嵌注释,以及正义/反义链注释和5'/3'末端标记。这些信息可在cdxml文件或粘贴的HELM字符串中保留,并会同步保存到SGROUPS的MOL文件中。
增强化学智能
累积二烯烃和阻转异构体的立体中心已由R/S更新为M/P。
ChemDraw现在将配位键与给予键视为相同类型,确保对这类化学等效键进行一致的价态计算与立体化学识别。此外,配位键和给予键可相互匹配搜索,但不会与单键匹配。
对MOL文件中DISPLAY选项的处理也已更新: 若MOL文件中未包含DISP值,则默认设置为COORD; 配位键的DISP值始终设置为COORD。